日本历来对中国古籍珍本极其重视。侵占南京以后，日本派出大批学者和僧侣来搜集整理在南京等地劫掠的书籍，他们对南京的图书馆、博物馆等建筑进行了严格监控。多达一千名日本僧侣和学者来到南京，对籍进行整理并编订目录。部分图书资料被登记装箱，日本征召了200多名中国劳工进行打包，动用了00辆卡车将书籍运到上海，最后运回日本。